scalable minds GmbH

scalable minds GmbH 是一家总部位于德国波茨坦的软件公司，专注于开发处理超大规模生物医学图像数据集的工具与服务。其最知名的产品是 WEBKNOSSOS——一个用于查看、标注和分析大规模图像数据的开源网络平台。根据公司自身的介绍，WEBKNOSSOS 支持用户在线可视化从 GB 级到 PB 级的二维和三维数据集，进行协作式标注（骨架与分割），与协作者安全共享数据集，并针对三维显微成像以及 MRI/CT 扫描进行了优化。该平台提供免费入门入口（“Get started for free”），同时配套商业服务。 除 WEBKNOSSOS 软件外，scalable minds 还将自身定位为图像分析与重建项目的服务提供商。其服务组合包括神经元分割与连接组重建、体积电子显微镜对齐与拼接、归一化与梯度校正、Zarr 咨询以及定制 AI 服务。公司表示其分割与重建服务基于 Voxelytics 技术，并已在 WEBKNOSSOS 和 Voxelytics 中实现了完整的 Zarr 支持。其宣称的使命是将领域专家与最新的机器学习专业知识连接起来，并强调其技术栈可从 GB 级扩展到 PB 级数据集。 公司的客户群体为科研机构。其网站上的客户评价来自马克斯·普朗克脑研究所和弗朗西斯·克里克研究所等机构的研究人员，其服务面向生物成像（含 OME-Zarr）、神经科学、连接组学以及其他处理大规模 n 维数据的领域。网站提及的典型应用包括神经元、细胞和细胞膜等生物特征的分割，细胞器识别，受损组织与病灶检测，以及已识别结构的自动计数与测量。支持的成像模态包括二维和三维电子显微镜、MRI 与 CT、同步辐射 X 射线与微型 CT、共聚焦荧光显微镜和光学显微镜。 scalable minds 是一家私营公司。Wikidata 仅将其描述为位于德国波茨坦的一家公司。公司积极参与科学数据领域的开源与开放标准社区，尤其是在 Zarr 社区中，据其所述参与规范与库实现的开发。公司也公开招募人才，在网站上发布职位空缺。

根据 Wikidata 的记录，scalable minds GmbH 是一家位于德国波茨坦的公司。现有公开证据未说明其成立日期或创始人，但公司自称拥有“多年图像分析与重建项目的经验”，并且是多家重要研究机构所使用的科学软件的开发者。 公司的核心产品 WEBKNOSSOS 是一个用于查看、标注和分析大规模图像数据集的开源网络平台。它支持在线可视化从 GB 级到 PB 级的二维和三维数据集，通过骨架和分割进行协作式标注，安全共享数据集，并针对三维显微成像以及 MRI/CT 扫描进行了优化。WEBKNOSSOS 提供免费入门入口，并被研究人员使用；公司网站上的客户评价来自马克斯·普朗克脑研究所和弗朗西斯·克里克研究所等机构。 除 WEBKNOSSOS 外，scalable minds 还开发了 Voxelytics 技术，该技术支撑其神经元分割与连接组重建服务。公司将该服务描述为从二维或三维图像数据集中自动重建生物特征，涵盖分割、测量、定位与计数、连接组重建，以及神经元、细胞器、突触、病灶和组织的分析等任务。 随着时间推移，公司扩展为更广泛的服务业务。其服务组合包括体积电子显微镜对齐服务（三维对齐与配准、二维平面内拼接与拼图、归一化与梯度校正）、Zarr 咨询以及定制 AI 服务。对齐服务以全托管形式提供，无需编程：客户上传数据集即可获得结果，功能包括动态网格变换、支持任意形状的掩膜、基于 RANSAC 的全局对齐以及稳健的异常值检测。 在数据格式领域，scalable minds 积极参与 Zarr 社区。公司表示其参与 Zarr 规范与库实现的开发，并已在 WEBKNOSSOS 和 Voxelytics 中实现了完整的 Zarr 支持。其 Zarr 咨询业务涵盖将 Zarr 支持集成到客户软件中、针对特定用例优化 Zarr 数据、云端或 HPC 上的分布式计算、最佳实践咨询、规范与社区工作的协作，以及定制主题的工作坊。 公司的定制 AI 服务扩展了其标准化的预处理、对齐、分割与重建服务。公司将其使命描述为将领域专家与最新的机器学习专业知识连接起来，并表示可提供包括训练数据生成、模型开发和校对在内的全流程服务，其技术栈可从 GB 级扩展到 PB 级数据集。支持的成像模态涵盖二维和三维电子显微镜、MRI 与 CT、同步辐射 X 射线与微型 CT、共聚焦荧光显微镜和光学显微镜。公司持续运营并招聘，在网站上发布职位空缺。

面向大规模生物医学图像分析的科学软件与服务提供商，将开源平台（WEBKNOSSOS）与专家咨询及 AI 驱动的重建服务相结合。

• WEBKNOSSOS

  用于查看、标注和分析大规模图像数据集的开源网络平台；支持从 GB 级到 PB 级的二维和三维数据集、协作式骨架与分割标注、安全共享，并针对三维显微成像和 MRI/CT 扫描进行了优化。

• Voxelytics

  支撑 scalable minds 神经元分割与连接组重建服务的技术；已在其上实现完整的 Zarr 支持。

• 神经元分割与连接组重建服务

  基于 Voxelytics 技术，从二维或三维图像数据集中自动重建生物特征的服务；涵盖分割、测量、定位与计数、连接组重建，以及神经元、细胞器、突触、病灶和组织的分析。

• 体积电镜对齐服务

  针对三维电子显微镜数据集对齐以及二维平面内拼接与拼图的全托管服务，具备动态网格变换、掩膜、基于 RANSAC 的全局对齐、稳健异常值检测，以及归一化与梯度校正；无需编程。

• Zarr 咨询

  围绕 Zarr 分块、云原生存储格式的咨询，包括将 Zarr 支持集成到客户软件、优化 Zarr 数据、云端或 HPC 上的分布式计算、最佳实践咨询、规范与社区协作，以及工作坊。

• 定制 AI 服务

  匹配客户数据与图像分析需求的灵活 AI 解决方案，包括训练数据生成、模型开发和校对；示例包括生物特征分割、细胞器识别、受损组织与病灶检测，以及自动计数与测量。

1. 1scalable mindsscalableminds.com
2. 2scalable minds | Zarr Consultingscalableminds.com
3. 3scalable minds | Volume EM Alignment Servicescalableminds.com
4. 4scalable minds | Custom AI Servicesscalableminds.com
5. 5scalable minds GmbH (Germany) - Wikidatawikidata.org