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塞莱拉公司

一家以大规模鸟枪法测序应用于人类基因组及其他生物体而闻名的生物技术公司。

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概览

塞莱拉公司是一家美国生物技术公司,由PE公司(后更名为Applera)于1998年成立。公司旨在生成、分析和商业化基因组信息,并成为人类基因组测序竞赛中最著名的私营参与者之一。公司最初在马里兰州罗克维尔运营,后将总部迁至加利福尼亚州阿拉米达。 塞莱拉早期的身份与J·克雷格·文特尔密切相关,他在领导基因组研究所的基因组研究后成为公司首任总裁。在TIGR,文特尔和汉密尔顿·史密斯帮助完成了首个自由生活生物——流感嗜血杆菌的完整基因组序列。塞莱拉在此基础上,采用高通量测序、计算分析和全基因组鸟枪法策略。公司并非仅通过漫长、分阶段的作图过程来组装基因组,而是生成并计算组装大量随机片段化的DNA序列。 公司最重要的项目是对人类基因组的测序。塞莱拉的努力与公共资助的人类基因组计划并行,成为其高度可见的商业和科学竞争对手。这种竞争促使公共项目加快了时间表。塞莱拉声称,其能够以远低于公共项目的资金完成人类基因组序列,尽管其工作受益于通过GenBank公开可用的现有序列数据以及更广泛基因组学界开发的技术和科学进步。 塞莱拉的商业模式不仅依赖于测序,还依赖于基因组数据库、分析工具和生物信息访问的商业价值。其最初的数据访问方式招致了研究人员的批评,他们认为限制部分基因组序列的商业开发可能会减缓科学进展。公司后来在访问条件下将其序列数据提供给非商业研究使用,包括限制一次可下载的数据量。这场辩论使塞莱拉成为开放科学资源与专有生物技术信息之间紧张关系的重要案例研究。 塞莱拉还测序或参与了果蝇、蚊子、小鼠和人类等生物的测序项目。随着时间的推移,公司的战略重点从主要作为基因组测序挑战者转向诊断和医疗保健相关应用。2008年,塞莱拉从Applera分离为独立公司。Quest Diagnostics于2011年收购了塞莱拉,此后塞莱拉成为Quest诊断导向业务结构的一部分。塞莱拉的名字仍然与基因组测序、生物信息学、人类基因组竞争以及大规模生物数据商业化相关联。

沿革

塞莱拉公司于1998年5月由PE公司(一家生命科学公司,后更名为Applera)创建。其最初目的是将大规模DNA测序和基因组分析转变为商业业务。公司总部最初位于马里兰州罗克维尔,后迁至加利福尼亚州阿拉米达。J·克雷格·文特尔成为其首任总裁。在加入塞莱拉之前,文特尔是基因组研究所的领军人物,在那里他与汉密尔顿·史密斯参与了首个自由生活生物流感嗜血杆菌完整基因组测序。 塞莱拉进入基因组学行业时,测序技术、计算能力和公共生物数据库正在快速发展。其核心技术方法是全基因组鸟枪法测序。DNA被破碎成许多片段,并行测序,并通过识别重叠读数进行计算重建。这种方法旨在减少测序大型基因组的时间和成本,并使塞莱拉在公共资助的人类基因组计划使用的更系统的作图和测序策略中占据独特地位。 人类基因组计划使塞莱拉在国际上声名鹊起。该公司声称,它可以用约3亿美元的私人资金测序人类基因组,而公共项目则约需30亿美元。这种比较并不完全等同:塞莱拉受益于公开可用的序列信息,包括通过GenBank分发的数据,并在其他地方已经完成大量工作之后进入该项目。尽管如此,其计算和测序策略对公共项目产生了竞争压力,促使其加快进度,比原计划更早完成。 塞莱拉的人类基因组工作也引发了关于生物信息所有权和可用性的重大问题。批评者反对私营公司测序的基因组部分可能被扣留或仅以商业条款提供的可能性。他们将其与公共项目公开释放序列数据的承诺进行对比。塞莱拉随后调整了政策,将序列信息提供给非商业研究使用,同时保留诸如在给定时期内可下载数据量限制等条件。这场争议成为关于基因组专利、科学开放性、数据库访问以及公共相关生物知识商业化的更广泛历史的一部分。 除了人类基因组,塞莱拉的测序组合还包括果蝇、冈比亚按蚊和小鼠,以及主要与文特尔遗传物质相关的人类基因组。这些项目表明该公司有兴趣跨物种应用测序和计算组装,而不是将人类基因组视为单一的孤立成就。塞莱拉试图通过数据库、分析能力和相关技术将基因组信息商业化。 随着商业基因组市场的发展,公司后来转向诊断和医疗保健应用。塞莱拉作为Applera业务部门运营,并与Applera追踪股票相关联,与较大的应用生物系统集团并列。2008年,它被分拆为独立公司。Quest Diagnostics于2011年收购了塞莱拉,将该业务置于主要的诊断组织内。因此,塞莱拉既作为一家独立的生物技术公司被铭记,也作为Quest Diagnostics基因组和分子诊断活动发展的重要阶段。其历史重要性在于测序创新、计算生物学、私人投资、公共研究以及围绕基因组数据访问的未解决商业和伦理问题的相互作用。

  • 2011

    Quest Diagnostics收购塞莱拉

    [1]

    Quest Diagnostics收购塞莱拉,并将其纳入其诊断和医疗保健导向的运营中。

  • 2008

    塞莱拉从Applera分拆

    [1]

    塞莱拉在作为Applera业务部门运营后成为独立公司。

  • 2003

    人类基因组计划达到完成里程碑

    [1]

    公共人类基因组计划比原定时间表更早完成其工作,这一进展部分归因于塞莱拉竞争性测序项目所推动的加速。

  • 2000

    宣布人类基因组草图序列

    [1]

    塞莱拉的私人测序工作与公共资助的人类基因组计划并行产生了人类基因组草图序列,加剧了竞争和关于数据访问的公开讨论。

  • 1998

    塞莱拉公司成立

    [1]

    PE公司成立塞莱拉,作为旨在生成和商业化大规模遗传信息的基因组学业务。J·克雷格·文特尔成为其首任总裁。

产品与定位

一家生物技术和基因组学公司,定位围绕高通量DNA测序、计算基因组组装、基因组信息以及后来的诊断应用。

  • 基因组测序 · 2000

    人类基因组序列

    塞莱拉最著名的科学成果是其人类基因组草图序列,通过高通量测序和全基因组鸟枪法组装产生。该项目使公司成为人类基因组计划的私人竞争对手,并展示了将自动化测序与大规模计算分析相结合的潜力。塞莱拉的工作部分依赖于现有的公共序列资源,并成为关于基因组数据商业访问辩论的核心。

  • 测序技术 · 1998

    全基因组鸟枪法测序

    塞莱拉使用全基因组鸟枪法策略,将DNA片段化、并行测序,并通过重叠读数的计算比较进行组装。该方法旨在提高测序大型基因组的速度并降低成本。它成为塞莱拉身份的定义性部分,并促进了基因组学中计算密集型方法的更广泛采用。

  • 生物信息学

    基因组信息数据库

    塞莱拉试图通过数据库和相关分析技术将基因组信息商业化。这些资源旨在支持序列数据的解释,并围绕生物信息访问而非仅测序创建业务。公司的访问政策成为关于专有数据库与开放科学研究之间平衡讨论的突出话题。

  • 基因组测序

    比较基因组序列

    塞莱拉测序或参与了涉及多种生物的测序工作,包括果蝇、冈比亚按蚊和小鼠。这些项目将公司的能力扩展到人类基因组学之外,并为研究跨物种的基因、基因组和生物变异提供了比较材料。

  • 分子诊断

    诊断和医疗保健应用

    在后期,塞莱拉转向诊断和医疗保健相关应用。这一战略方向反映了公司试图将基因组专业知识转化为更接近临床使用的产品和服务,最终于2011年被Quest Diagnostics收购。

品牌决策

  • 2011

    将塞莱拉出售给Quest Diagnostics并购

    背景

    塞莱拉后期的业务方向日益集中于诊断和医疗保健应用。

    采取的行动

    Quest Diagnostics收购了塞莱拉。

    后续影响

    塞莱拉成为Quest Diagnostics的一部分,其基因组能力被置于更大的诊断组织内。

  • 2008

    将塞莱拉从Applera分离其他

    背景

    塞莱拉曾作为Applera业务部门运营,并与Applera追踪股票相关联。

    采取的行动

    Applera将塞莱拉分拆为独立公司。

    后续影响

    塞莱拉继续独立运营,直到2011年被Quest Diagnostics收购。

  • 1998

    与人类基因组计划进行商业竞争战略

    背景

    塞莱拉的成立旨在使基因组测序和生物信息成为商业企业,而一个公共资助的国际项目已经在测序人类基因组。

    采取的行动

    公司采用高通量测序、全基因组鸟枪法组装、计算生物学和商业基因组信息模型。

    后续影响

    塞莱拉成为突出的私人竞争对手,促使公共项目加速,并帮助使基因组数据的商业和伦理地位成为基因组学的核心问题。

    • Human Genome Project — 公共项目加速了其时间表,并在面对塞莱拉的竞争性测序工作时走向完成。
  • 修改塞莱拉序列数据的访问战略

    背景

    研究人员批评塞莱拉最初对其部分基因组序列数据的限制,认为商业控制可能阻碍科学进步。

    采取的行动

    塞莱拉将其序列数据提供给非商业使用,同时保留访问条件,包括限制一次可下载的信息量。

    后续影响

    政策变化减少了与公共项目开放获取方法的对比,但保留了围绕塞莱拉基因组资源的商业框架。

  • 转向诊断和医疗保健战略

    背景

    在高调测序时期之后,塞莱拉寻求其基因组能力在参考基因组序列生产之外的应用。

    采取的行动

    公司将重点转向诊断和医疗保健相关活动。

    后续影响

    这一方向使塞莱拉更紧密地与诊断行业对齐,并为其被Quest Diagnostics收购铺平了道路。

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